Pengujian ini digunakan untuk mengukur tingkat infeksi atau kolonisasi fungi mikoriza arbuskula pada jaringan akar tanaman. Analisis dilakukan melalui proses clearing dan staining akar, kemudian diamati di bawah mikroskop untuk mengidentifikasi struktur khas seperti arbuskula, vesikula, dan hifa internal. Hasil dinyatakan dalam persentase kolonisasi akar (%), yang menggambarkan tingkat keberhasilan simbiosis antara fungi dan tanaman.
